中秘贸易关系在建交前仅有少量民间往来。1971年以来，双边贸易发展较快。1972年，两国签定了政府间贸易协定。1983年，在保留原协定的基础上，双方签署贸易协定补充议定书。80年代前，两国贸易额一直徘徊在1亿美元左右。

　　90年代以来，随着两国关系的不断加强，贸易关系取得较显著的发展，秘成为我在拉美的主要贸易和投资对象国之一。1991年双边贸易额首次超过3亿美元。2003年12月，秘鲁宣布对中国纺织品实行为期200天的临时性特别保护措施。2006年，双边贸易额39.2亿美元，同比增长35.7%，其中我出口10.1亿美元，进口29.1亿美元，同比分别增长65.6%和27.7%。2007年1-7月，双边贸易额33.5亿美元，同比增长62.8%，其中我出口8.2亿美元，进口25.3亿美元，同比分别增长61.5%和63.3%。目前，我是秘第二大贸易伙伴国和出口市场。两国贸易中我长期逆差。

　　中国从秘进口的主要商品有鱼粉、饲料和矿产品等；向秘出口的主要商品有机械设备、轻工业品、化工原料、焦炭、医药和工农具等。